Contoh berikutnya adalah kasus sikap pemerintah era Presiden SBY pada kasus PKB Gus Dur dan Muhaimin Iskandar.
Mahfud MD memberikan penjelasan bahwa contoh kasus tersebut merupakan urusan internal parpol.
"Sama juga dengan sikap pemerintahan Pak SBY ketika (2008) tidak melakukan pelarangan saat ada PKB versi Parung (Gus Dur) dan versi Ancol (Cak Imin). Alasannya, itu urusan internal parpol," ujar Mahfud MD menjelaskan duduk perkaranya.***