Pada babak kedua, Madura United kembali mengambil inisiatif menyerang terlebih dahulu dan sempat mengancam melalui tendangan dari Hugo Gomes yang masih bisa diamankan oleh Gianluca Pandeynuwu.
Selanjutnya giliran Kei Hirose yang memberikan ancaman setelah memanfaatkan kesalahan lini belakang dari Madura United, namun tendangannya masih melambung di atas mistar gawang Hong Jung-nam.
Baca Juga: Kumpulan Link Twibbon Ramadhan 2022 Gratis, Cocok Dibagikan di Media Sosial
Madura United akhirnya mampu memecah kebuntuan pada menit ke-87 setelah Hugo Gomes mengirimkan umpan kepada Slamet Nurcahyo yang mampu mencetak gol dan mengubah skor menjadi 1-0.
Di sisa waktu babak kedua, Borneo FC terus melakukan tekanan untuk menyamakan kedudukan, namun hingga peluit panjang berbunyi skor 1-0 untuk kemenangan Madura United tetap bertahan.***